Στις αρμοδιότητες του Ποινικού Τμήματος υπάγονται οι εξής εργασίες:
- Η εκτέλεση των καθηκόντων των γραμματέων έδρας όλων των ποινικών δικαστηρίων και ειδικότερα η συμμετοχή στην σύνθεση όλων των ποινικών δικαστηρίων, η σύνταξη των πρακτικών και η καθαρογραφή των αποφάσεων.
- Η δημοσίευση των ποινικών αποφάσεων και η διακίνηση των ποινικών δικογραφιών.
- Η έκδοση αντιγράφων και αποσπασμάτων ποινικών αποφάσεων και των εγγράφων της ποινικής διαδικασίας και υποβολή των αναβλητικών αποφάσεων μετά των δικογραφιών.
- Η παράδοση των ποινικών δικογραφιών στους Προέδρους και η παραλαβή τους για τακτοποίηση στο αρχείο.
- Η σύνταξη δελτίων Ποινικού Μητρώου και στατιστικών δελτίων.
- Η σύνταξη πινάκων με την εργασία και την εκκρεμότητα των δικαστικών λειτουργών.
- Η συγκέντρωση των απαραίτητων στοιχείων για την διευκόλυνση της επιθεωρήσεως και η συμπλήρωση των ατομικών δελτίων κάθε δικαστού.
- Η αλληλογραφία του Τμήματος.
- Η καταχώρηση των εισερχομένων και εξερχομένων εγγράφων του Τμήματος στο Ηλεκτρονικό Βιβλίο Πρωτοκόλλου (Αλληλογραφίας) του Εφετείου Ιωαννίνων και η εν συνεχεία διεκπεραίωση αυτών.
- Η εκτύπωση των ηλεκτρονικών βιβλίων και η μέριμνα για την βιβλιοδέτησή τους.